Programme

Programme détaillé:

Lundi 1^er décembre
13:00 - 13:45 Accueil
13:45 - 14:00 Mots de bienvenue et d'introduction aux FROGSDays
14:00 - 14:30 Rétrospective FROGS 2015-2025 (Géraldine Pascal, UMR GenPhySE, INRAE Occitanie-Toulouse)
14:30 - 15:15 Retours d'expérience sur l'analyse métabarcoding faite à grande échelle (Frédéric Mahé, UMR PHIM, CIRAD Montpellier)
15:15 - 16:00 Retours d'expérience : Le métabarcoding pour l'analyse de la diversité (Sylvie Combes, UMR GenPhySE, INRAE Occitanie-Toulouse)
16:00 - 16:30 Pause-café
16:30 - 17:15 Retours sur les résultats du projet Meta PDO Cheese (Françoise Irlinger, UMR SayFood, INRAE Ile-de-France - Versailles-Saclay)
17:15 - 18:00 Session poster en mode speed-dating scientifique
18:00 - 19:00 Cocktail de bienvenue

Mardi 2 décembre
9:00 - 9:45 Retours sur « activité physique et microbiote » chez la souris (Bénédicte Goustard, UMR DMeM, INRAE Occitanie-Montpellier)
9:45 - 10:15 Évolutions des technologies de séquençage (Jérôme Lluch, US GeT-PlaGe, INRAe Occitanie - Toulouse)
10:15 - 10:45 Pause-café
10:45 - 11:30 Outils statistiques pour la diversité microbienne (Mahendra Mariadassou, UR MaIAGE, INRAE Ile-de-France - Jouy-en-Josas - Antony)
11:30 - 12:15 Session poster en mode speed-dating scientifique
12:15 - 13:45 Déjeuner
13:45 - 14:30 Retours d’expérience sur l'étude des sols par métabarcoding  (Aurélie Deveau, UMR IAM, INRAE Grand-Est - Nancy)
14:30 - 15:00 Limites et avantages du séquençage métabarcoding long-reads ? (Géraldine Pascal,  UMR GenPhySE, INRAE Occitanie-Toulouse et Maëlle Pomies, UMR IAM, INRAE Nancy)
15:00 - 16:00 Table ronde: métagénomique/métabarcoding ; DADA2/Swarm ; short-reads/long-reads ; 16S/Autres marqueurs (Lucas Auer, UMR IAM, INRAE Nancy, et Géraldine Pascal, UMR GenPhySE, INRAE Occitanie-Toulouse)
16:00 - 16:30 Pause-Café
16:30 - 17:30 Table ronde sur vos besoins: dans FROGS, d'autres fonctionnalités, d'autres outils, en terme de formations, de tutoriels (Maria Bernard, UMR GABI, Sigenae, INRAE Jouy-en-Josas, et Géraldine Pascal, UMR GenPhySE, INRAE Occitanie-Toulouse)

Mercredi 3 décembre
9:00 - 9:45 L'utilisation de l'IA dans la caractérisation des microbiotes (Pierre Peyret, Université de Clermont-Ferrand)
9:45 - 10:15 Métabarcoding/Métagénomique (Maria Bernard, UMR GABI, Sigenae, INRAE Jouy-en-Josas)
10:15 - 10:45 Pause-café
10:45 - 11:00 Démo de l'outil Easy16S (Cédric Midoux, UR PROSE, INRAE Ile-de-France - Jouy-en-Josas - Antony)
11:00 - 11:15 Démo de la plateforme LEAP (Olivier Rué, UR MaIAGE, Migale, INRAE Jouy-en-Josas)
11:15 - 11:45 Présentation sur l'outil Taxon mArker Design (Gabryelle Agoutin, UMR GenPhySE, INRAE Occitanie-Toulouse)
11:45 - 12:30 FROGS 5 et site web (Olivier Rué, UR MaIAGE, Migale, INRAE Jouy-en-Josas, et Maëlle Pomiès, UMR IAM, INRAE Nancy)
12:30 - 12:35 Mots de clôture et de remerciements